연남동님께서 좋은 독일어 사전을 추천해주셨네요. 독일어가 가능하시다면 큰 도움이 될듯합니다.

사실 키케로나 카이사르가 주로 사용하던 어휘들을 따로 모아놓은 사전은 없는 것으로 알고 있습니다. 사실 격변화나 동사 과거형 변화가 일부 불규칙한 부분이 있지만, 주로 쓰이는 어휘들을 살펴보다보면 불규칙에도 나름 규칙이 있다는 것을 발견할 수 있습니다. 따라서 변화형을 보고 원형 찾는게 그렇게 어렵지는 않을거라는게 제 개인적인 생각입니다. 그래서 개인적으로는 기본적인 단어 숙달이 되셨다면, 단어 공부와 원문 강독을 별도로 진행하시지 마시고, 원문 강독 중에 등장하는 단어들에 대해 공부하는 식으로 진행하시는걸 추천드립니다.

혹은 본 사이트에서 최근 사용 빈도에 따른 단어 색인 기능을 지원하고 있으니, 이를 통해 상위 2000~3000 단어를 살펴보시는 것도 나쁘지 않아보입니다. (라틴어 단어 색인 페이지 하단에 빈도수별 색인 기능이 있습니다.)