1. 네 말씀하신대로 한 어근에서 여러 단어가 파생됩니다. 동사에서 명사로 가는 경우도 있고 반대도 있고, 영어의 파생처럼 생각하시면 됩니다. 특이할 만한 점은 라틴어 접두사 중 많은 수가 라틴어 전치사와 형태가 유사하고 의미도 유사해서, 어근과 접두사, 접미사를 구분해내면 그 의미를 파악하기가 쉽다는 점이 있겠습니다.

2. 본 사이트의 사전은 기본적으로 Lewis와 Short의 Latin Dictionary (1879) 내용을 바탕으로 하고 있습니다. 이게 좀 오래된 내용이라서 집필 당시에 추정하던 어원과 현재 추정되는 어원이 조금 다르게 표기되는 경우가 있습니다. 3 MA-나 1 MA-라고 쓰여있는 것은 말씀하신 것처럼 인도유럽조어의 재구형태를 추정하여 쓴 것인데요, 현재 쓰이는 표기를 찾아보시려면 사전 페이지 밑에 '이 단어를 Wiktionary에서 찾기 (영어)'를 클릭하셔서, wiktionary에서 어원을 찾아보시는게 정확할 듯합니다.

Wiktionary를 참고한 결과 말씀하신대로 측정과 관련된 어원으로 *meh-와 *med- 가 있고, 질문에서 제시하신 단어들은 이 어근에서 파생된 것으로 보입니다.

라틴어 공부에 도움이 되시면 좋겠네요 감사합니다.