먼저 장모음, 단모음이라는 표현에서 혼동이 있는듯합니다. 고전 라틴어 강세 규칙에서는 음절 전체의 장단을 기준으로 강세를 매깁니다. 단순히 그 음절의 모음이 단모음인지, 장모음인지로 구별하는게 아닙니다. 그런데 편의상 단모음/장모음이라는 표현을 음절에다가도 사용해서 헷갈릴 여지가 있지요. 여기서는 음절을 Heavy와 Light로 나눠서 설명하겠습니다. (줄여서 H/L로 씁니다.)

H음절은 다음과 같습니다. 1) 장모음이나 이중모음이 있는 경우 2) 단모음에 자음이 따라오는 경우 3) 장모음/이중모음에 자음이 따라오는 경우

나머지 경우는 Light 음절이 됩니다. 즉 단모음이고, 자음이 따라오지 않는 경우만 L 음절입니다.

강세 규칙은 질문에서 설명하신대로입니다. 다만 장모음->H음절, 단모음->L 음절로 바꿔서 이해하시면 될거같습니다.